MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	AT	3	6	852	857	50 %	50 %	0 %	0 %	11497374
2	NC_000956	TTGG	2	8	865	872	0 %	50 %	50 %	0 %	11497374
3	NC_000956	ATA	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497374
4	NC_000956	GCA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497374
5	NC_000956	GTT	2	6	905	910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497374
6	NC_000956	T	7	7	945	951	0 %	100 %	0 %	0 %	11497374
7	NC_000956	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	11497374
8	NC_000956	GAG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497374
9	NC_000956	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497374
10	NC_000956	GTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497374
11	NC_000956	A	6	6	1200	1205	100 %	0 %	0 %	0 %	11497374
12	NC_000956	AAT	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497374
13	NC_000956	CAA	2	6	1345	1350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497374
14	NC_000956	AG	3	6	1364	1369	50 %	0 %	50 %	0 %	11497374
15	NC_000956	AGAA	2	8	1374	1381	75 %	0 %	25 %	0 %	11497374
16	NC_000956	TA	3	6	2753	2758	50 %	50 %	0 %	0 %	11497375
17	NC_000956	TG	5	10	2759	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	11497375
18	NC_000956	T	7	7	2769	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	11497375
19	NC_000956	AAG	2	6	2814	2819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497375
20	NC_000956	AAGC	2	8	2865	2872	50 %	0 %	25 %	25 %	11497375
21	NC_000956	AGA	3	9	2878	2886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497375
22	NC_000956	A	7	7	2894	2900	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
23	NC_000956	A	6	6	2902	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
24	NC_000956	TAA	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497375
25	NC_000956	A	6	6	2970	2975	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
26	NC_000956	AAG	2	6	2982	2987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497375
27	NC_000956	A	6	6	3071	3076	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
28	NC_000956	A	6	6	3082	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
29	NC_000956	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	11497375
30	NC_000956	GAC	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497375
31	NC_000956	A	6	6	3236	3241	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
32	NC_000956	A	6	6	3283	3288	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
33	NC_000956	CTAT	2	8	3305	3312	25 %	50 %	0 %	25 %	11497375
34	NC_000956	TTA	2	6	3347	3352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497375
35	NC_000956	AAC	2	6	3426	3431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497375
36	NC_000956	A	6	6	3437	3442	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
37	NC_000956	A	7	7	3495	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	11497375
38	NC_000956	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	11497376
39	NC_000956	TGG	3	9	3778	3786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497376
40	NC_000956	ACT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497376
41	NC_000956	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497376
42	NC_000956	TAA	2	6	3882	3887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497376
43	NC_000956	GGA	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497376
44	NC_000956	TAT	2	6	3897	3902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497376
45	NC_000956	AGG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497376
46	NC_000956	GCA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497376
47	NC_000956	A	7	7	3992	3998	100 %	0 %	0 %	0 %	11497376
48	NC_000956	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	11497376
49	NC_000956	AG	3	6	4108	4113	50 %	0 %	50 %	0 %	11497376
50	NC_000956	CTAAA	2	10	4244	4253	60 %	20 %	0 %	20 %	11497377
51	NC_000956	GTA	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497377
52	NC_000956	A	6	6	4269	4274	100 %	0 %	0 %	0 %	11497377
53	NC_000956	C	7	7	4277	4283	0 %	0 %	0 %	100 %	11497377
54	NC_000956	CGA	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497377
55	NC_000956	CAT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497377
56	NC_000956	AT	3	6	4360	4365	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
57	NC_000956	T	9	9	4394	4402	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
58	NC_000956	ATTA	2	8	4423	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
59	NC_000956	CTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497377
60	NC_000956	T	6	6	4447	4452	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
61	NC_000956	A	8	8	4456	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	11497377
62	NC_000956	TCT	2	6	4496	4501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497377
63	NC_000956	TTC	2	6	4526	4531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497377
64	NC_000956	A	6	6	4534	4539	100 %	0 %	0 %	0 %	11497377
65	NC_000956	T	7	7	4551	4557	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
66	NC_000956	ATT	2	6	4558	4563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497377
67	NC_000956	T	7	7	4582	4588	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
68	NC_000956	TAA	2	6	4594	4599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497377
69	NC_000956	AAATAC	2	12	4694	4705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11497377
70	NC_000956	T	9	9	4780	4788	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
71	NC_000956	TAT	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497377
72	NC_000956	ATC	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497377
73	NC_000956	ATT	2	6	4867	4872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497377
74	NC_000956	TAAT	2	8	4874	4881	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
75	NC_000956	CTA	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497377
76	NC_000956	T	6	6	4963	4968	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
77	NC_000956	T	6	6	4975	4980	0 %	100 %	0 %	0 %	11497377
78	NC_000956	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497378
79	NC_000956	T	6	6	5103	5108	0 %	100 %	0 %	0 %	11497378
80	NC_000956	ATA	2	6	5117	5122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497378
81	NC_000956	GTA	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497378
82	NC_000956	TTC	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497378
83	NC_000956	T	6	6	5256	5261	0 %	100 %	0 %	0 %	11497378
84	NC_000956	ATT	2	6	5382	5387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497378
85	NC_000956	T	6	6	5412	5417	0 %	100 %	0 %	0 %	11497378
86	NC_000956	TGGG	2	8	5434	5441	0 %	25 %	75 %	0 %	11497378
87	NC_000956	AGA	2	6	5505	5510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497378
88	NC_000956	TTA	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497378
89	NC_000956	T	7	7	5618	5624	0 %	100 %	0 %	0 %	11497378
90	NC_000956	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
91	NC_000956	TCAA	2	8	5706	5713	50 %	25 %	0 %	25 %	11497378
92	NC_000956	T	6	6	5720	5725	0 %	100 %	0 %	0 %	11497378
93	NC_000956	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
94	NC_000956	A	6	6	5749	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	11497378
95	NC_000956	CCT	2	6	5781	5786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497378
96	NC_000956	TAT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497379
97	NC_000956	TCCT	2	8	5842	5849	0 %	50 %	0 %	50 %	11497379
98	NC_000956	T	7	7	5856	5862	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
99	NC_000956	T	6	6	5883	5888	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
100	NC_000956	T	6	6	5894	5899	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
101	NC_000956	TGTT	2	8	5929	5936	0 %	75 %	25 %	0 %	11497379
102	NC_000956	T	8	8	5935	5942	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
103	NC_000956	T	6	6	5992	5997	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
104	NC_000956	T	6	6	6023	6028	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
105	NC_000956	TAT	3	9	6042	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497379
106	NC_000956	A	7	7	6061	6067	100 %	0 %	0 %	0 %	11497379
107	NC_000956	TCT	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497379
108	NC_000956	A	6	6	6140	6145	100 %	0 %	0 %	0 %	11497379
109	NC_000956	TCC	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497379
110	NC_000956	ATT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497379
111	NC_000956	AAT	2	6	6237	6242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497379
112	NC_000956	T	7	7	6246	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
113	NC_000956	TCT	2	6	6263	6268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497379
114	NC_000956	AGA	2	6	6279	6284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497379
115	NC_000956	T	8	8	6288	6295	0 %	100 %	0 %	0 %	11497379
116	NC_000956	GTT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497379
117	NC_000956	ATT	2	6	6853	6858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556575
118	NC_000956	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	364556575
119	NC_000956	ATC	2	6	7017	7022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556575
120	NC_000956	TGG	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556575
121	NC_000956	GAT	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556575
122	NC_000956	AAT	2	6	7193	7198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556575
123	NC_000956	TAG	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556575
124	NC_000956	TAA	2	6	7258	7263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556575
125	NC_000956	CAC	2	6	7293	7298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556575
126	NC_000956	TTTA	2	8	7359	7366	25 %	75 %	0 %	0 %	364556575
127	NC_000956	GTAA	2	8	7397	7404	50 %	25 %	25 %	0 %	364556575
128	NC_000956	ATT	2	6	7438	7443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556568
129	NC_000956	TGA	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556568
130	NC_000956	ATT	2	6	7452	7457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556568
131	NC_000956	TAA	2	6	7756	7761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556568
132	NC_000956	TC	3	6	7776	7781	0 %	50 %	0 %	50 %	364556568
133	NC_000956	ATT	2	6	7808	7813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556568
134	NC_000956	TTA	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556568
135	NC_000956	TTCAA	2	10	7849	7858	40 %	40 %	0 %	20 %	364556568
136	NC_000956	A	6	6	7867	7872	100 %	0 %	0 %	0 %	364556568
137	NC_000956	CTT	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556568
138	NC_000956	AGA	2	6	7930	7935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556568
139	NC_000956	GTG	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556568
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141	NC_000956	ATG	2	6	8033	8038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556568
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